北京大学体育教研部下设教学管理办公室、运动训练与竞赛管理中心、校园体育文化指导中心、科研管理办公室、场馆运行管理中心、研究生管理办公室、宣传与品牌建设办公室、党建办公室、财务办公室、行政办公室等部门，承担全校体育教学、体育科研、校园体育工作、高水平运动队的训练和体育场馆的管理运营等五大业务。目前，体育教研部正以一个基地、7个中心（妇女体育研究中心、体育健康研究中心、武术研究中心、养生研究中心、教学科研中心、体育产业研究中心等7个研究中心），还有体能、教学等3个实验室为龙头进行了大量的体育科研工作。